Die in fn2Web mitgeloggten Aktionen werden in der Datenbank in der Tabelle TALOG_FN2 gespeichert. Die Spalte Dienst liefert Informationen darüber, welche Aktion jeweils ausgeführt wurde.
Fehler in der Server-Komponente (FN2XML) werden in der Datei TOMCAT/logs/ErrorLog.xml protokolliert. Mittels des auf der Oberfläche angezeigten Zeitstempels kann eine Verbindung von der Aktion, die den Fehler ausgelöst hat, zu dem Protokolleintrag hergestellt werden.
In dem Linux-Derivat centOS werden Einträge aller Anwendungen in der Datei /var/log/messages protokolliert.